Les analyses portent sur le calcul de la correspondance des marqueurs génétiques entre l’ADN fœtal, l’ADN du père présumé et l’ADN d’un certain nombre d’individus non apparentés pris au hasard. Quand le père présumé comparé à tout autre individu pris au hasard, a les marqueurs génétiques exigés pour être considéré le père biologique, la probabilité obtenue est supérieure à 99,9 % et le résultat obtenu est d’une  ” Inclusion de la Paternité “. Si dans le cas contraire, les similitudes se trouvent dans la gamme des individus pris au hasard, le résultat est d’une ” Exclusion de la Paternité “.

Il est important de noter, qu’en raison des similarités génétiques entre les membres d’une même famille, si les pères présumés sont liés par des liens familiaux, il est nécessaire d’analyser l’échantillon de tous les pères présumés ; cette règle s’applique aussi dans le cas de pères présumés liés par une parenté lointaine. D’autre part, il est également obligatoire de tester tous les pères présumés, dans le cas où ces derniers font partie d’une petite population ou d’un groupe ethnique réduit. Dans de tels cas, l’ADN de tous les pères potentiels doit être analysé, sans l’analyse génétique du deuxième père présumé, le test peut mener à une conclusion erronée par rapport à l’homme testé.